Realisasi anggaran 2008 untuk Ristek, Bakorsultanal, BSN, BAPETEN, BATAN, BPPT, LIPI, LAPAN serta Lembaga Eijkman, Dewan Riset Nasional dan PP IPTEK berkisar antara 35 % sampai 70 %. Realisasi tersebut dipengaruhi beberapa kendala diantaranya APBNT 2008 dibuat pada awal tahun karena ada gejolak yang membuat asumsi anggaran berubah. Masalah teknis misalnya peraturan yang mengatur pengelola DIPA harus memiliki sertifikasi sehingga penerapannya harus dilaksanakan secara paralel di seluruh Ristek, LPND dan Lembaga. Selain itu juga disinggung masalah pinjaman dan hibah luar negeri yang perlu dibenahi dan transparansi demokrasi dalam pengelolaannya. Upaya – upaya yang dilakukan antara lain melakukan kontak yang lebih intensif dengan Ditjen Anggaran agar pencairan dana bisa lebih cepat terutama terjadinya pergeseran bersifat administrasi maupun teknis. Hal yang berkaitan dengan pengurusan dana – dana utang luar negeri diselesaikan dengan melibatkan koordinasi yang insentif dengan BAPENAS dan Deplu, serta melakukan konsultasi dengan BPK dan BPKP.

Enam tema pokok perhatian di jajaran Menegristek juga dijelaskan secara umum oleh Menristek Kusmayanto Kadiman yang kemudian lebih dijabarkan kembali oleh Kepala – Kepala Lembaga Non Departemen. Keenam tema sentral tersebut adalah riset berkaitan dengan pencukupan pangan, energi, teknologi informasi dan komunikasi, transportasi, pertahanan dan keamanan, serta farmasi. Diskusi dengan anggota Komisi VII DPR RI cukup menyita waktu karena banyaknya pertanyaan berkaitan dengan realisasi kegiatan dan penyerapan serta masalah dana APBN. Oleh karena itu jawaban Menristek terhadap pertanyaan – pertanyaan dari Anggota Dewan akan disampaikan secara tertulis.